Molecular distillationay isang espesyal na teknolohiya sa paghihiwalay ng likido-likido, na naiiba sa tradisyonal na paglilinis na umaasa sa prinsipyo ng paghihiwalay ng pagkakaiba sa punto ng kumukulo. Ito ay isang proseso ng distillation at purification ng heat-sensitive na materyal o mataas na boiling point na materyal gamit ang pagkakaiba sa libreng landas ng molecular motion sa ilalim ng mataas na vacuum. Pangunahing ginagamit sa kemikal, parmasyutiko, petrochemical, pampalasa, plastik at langis at iba pang larangan ng industriya.
Ang materyal ay inililipat mula sa sisidlan ng pagpapakain sa pangunahing distillation jacketed evaporator. Sa pamamagitan ng pag-ikot ng rotor at tuluy-tuloy na pag-init, ang materyal na likido ay nasimot sa isang napakanipis, magulong likidong pelikula, at itinulak pababa sa isang spiral na hugis. Sa proseso ng pagbaba, ang mas magaan na materyal (na may mababang punto ng kumukulo) sa materyal na likido ay nagsisimulang mag-vaporize, lumipat sa panloob na pampalapot, at nagiging likido na dumadaloy pababa sa light phase na tumatanggap ng flask. Ang mas mabibigat na materyales (tulad ng chlorophyll, salts, sugars, waxy, atbp.) ay hindi sumingaw, sa halip, ito ay dumadaloy sa kahabaan ng panloob na dingding ng pangunahing evaporator patungo sa heavy phase receiving flask.